1.萨尔瓦·巴莱斯塔（Salva Ballesta），西班牙前锋，来自桑坦德竞技队，该赛季西甲联赛出场36次，打进27球。
2.吉米·弗洛伊德·哈塞尔巴因克（Jimmy Floyd Hasselbaink），荷兰前锋，苏里南后裔，来自马德里竞技队，该赛季西甲联赛出场34次，打进24球。
卡塔尼亚（Catanha），巴西前锋，原名恩里克·格德斯·达·席尔瓦（Henrique Guedes da Silva），来自马拉加队，该赛季西甲联赛出场33次，打进24球。
5.萨沃·米洛舍维奇（Savo Milosevic），塞尔维亚前锋，来自萨拉戈萨队，该赛季西甲联赛出场37次，打进21球。
6.迭戈·特里斯坦（Diego Tristán），西班牙前锋，来自马洛卡队，该赛季西甲联赛出场35次，打进18球。
7.劳尔（Raul），西班牙前锋，来自皇家马德里队，该赛季西甲联赛出场34次，打进17球。
8.帕特里克·克鲁伊维特（Patrick Kluivert），荷兰前锋，来自巴塞罗那队，该赛季西甲联赛出场26次，打进15球。
9.盖兹坦·门迭塔（Gaizka Mendieta），右前卫，来自巴伦西亚队，该赛季西甲联赛出场33次，打进13球。
维克多·费尔南德斯（Víctor Fernández），前锋，来自巴拉多利德队，该赛季西甲联赛出场34次，打进13球。
1999/00赛季西甲联赛射手榜：
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